Next generation sequencing (NGS)-analyse bij vaste tumoren - Delta RNA FusionSeq uitgebreid panel
Moleculaire diagnostiek
Gemeten eigenschapNext generation sequencing (NGS)-analyse bij vaste tumoren - Delta RNA FusionSeq uitgebreid panel
Interne naamp83 RNA FusionSeq UITGEBREID panel
Afkortingp83_fusies_solide_EXT
Synoniem en aanverwantNGS, RNA, fusie-analyse, Archer FusionPlex Pan solid tumor v2, ACVR2A, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, AR, ARHGAP26, ARHGAP6, AXL, BCOR, BRAF, BRD3, BRD4, CAMTA1, CCNB3, CCND1, CD274, CIC, CRTC1, CSF1, CSF1R, CTNNB1, DNAJB1, EGF, EGFR, EPC1, ERBB2, ERBB4, ERG, ESR1, ESRRA, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, FGF1, FGFR1/2/3, FGR, FOS, FOSB, FOXO1, FOXO4, FOXR2, FUS, GLI1, GRB7, HMGA2, HRAS, IDH1, IDH2, IGF1R, INSR, JAK2, JAK3, JAZF1, KIT, KRAS, MAML2, MAP2K1, MAST1, MAST2, MBTD1, MDM2, MEAF6, MET, MGEA5, MKL2, MN1, MSMB, MUSK, MYB, MYBL1, MYC, MYOD1, NCOA1, NCOA2, NCOA3NFATC2, NFE2L2, NFIB, NOTCH1, NOTCH2, NR4A3, NRAS, NRG1, NTRK1/2/3, NUMBL, NUTM1, PAX3, PAX8, PDGFB, PDGFD, PDGFRA, PDGFRB, PHF1, PHKB, PIK3CA, PKN1, PLAG1, PPARG, PRDM10, PRKACA, PRKACB, PRKCA, PRKCB, PRKCD, PRKD1/2/3, RAD51B, RAF1, RELA, RET, ROS1, RSPO2, RSPO3, SS18, SS18L1, STAT6, TAF15, TCF12, TERT, TFE3, TFEB, TFG, THADA, TMPRSS2, USP6, VGLL2, WWTR1, YAP1, YMHAE
Intern codenummer5810 (UITGEBREID RNA panel)
Ook standaard aangevraagd bij volgende codes: 5758 Hersenpanel, 5755 Sarcoom panel, 5789 schildklier panel, 5809 Speekselklier panel, 5808 Nier panel, 5802 Integraal NGS panel,

Afnamemateriaal zie instructies
Afnamemateriaal (afgekort) zie instructies
Minimum benodigde hoeveelheidminimum 15 coupes van 10µm gesneden door het Labo voor Pathologie van het AZ delta, zie ook instructies.
InterferentieBouin fixatief
AvonddienstNeen
WeekenddienstNeen
Mogelijk dringende bepalingNeen
Frequentie van bepaling1x per week
Dag van bepalingDonderdag
Antwoordtijd
(Tijd tussen staalontvangst en volledig resultaat)		maximum 12 dagen voor stalen waar RNA standaard wordt uitgevoerd
maximum 18 dagen voor stalen waar RNA op indicatie wordt uitgevoerd
Stalen moeten ten laatste op maandag- of woensdagochtend in het labo voor pathologie aanwezig zijn, om met de daaropvolgende extractie-run meegenomen te worden.
Max. tijd afname - ontvangst laboNiet van toepassing, analyse op paraffine ingebed weefsel (opmerking biopsie moet na afname zo snel mogelijk worden gefixeerd in 4% gebufferde formaldehyde).
InstructiesAfnamemateriaal: Bij voorkeur biopsie, eventueel cytologieblok

Afnameinstructies:

Voor interne stalen:
Biopsie na afname zo snel mogelijk fixeren in fosfaatgebufferde formaldehyde (4%, te verkrijgen via het Laboratorium voor Pathologie) en doorsturen naar het Laboratorium voor Pathologie. Fixatietijd tussen 4 en 48 uren.

Voor externe stalen:
Gelieve het paraffineblok met het ingebedde weefsel alsdusdanig door te sturen naar het Laboratorium voor Pathologie van het AZ delta, samen met een kopij van het anatomopathologisch verslag en ondervermeld aanvraagformulier.

Exclusiecriteria:
- Bouin fixatief uitgesloten
- Weefsels gefixeerd in andere fixatieven dan 4% gebufferde formaldehyde worden geanalyseerd onder voorbehoud.

Opmerking: indien het tumorcelpercentage lager is dan 10% na eventuele macrodissectie, wordt dit bij een negatief resultaat vermeld in het rapport (resultaat niet conclusief).
Aanvraag formulierMoleculaire pathologie